SysQuan Human Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/µg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/µg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13094	LCP2	STKPPLDR	Spleen	—	100.0	None	—
Q13098	GPS1	DSQTQAILTK	dbs	—	100.0	None	—
Q13098	GPS1	DSQTQAILTK	Heart	—	100.0	None	—
Q13098	GPS1	VSVYLQNWSHVLSYVSK	dbs	—	100.0	None	—
Q13098	GPS1	VSVYLQNWSHVLSYVSK	kidney	—	100.0	None	—
Q13098	GPS1	VSVYLQNWSHVLSYVSK	liver	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASLIQPTQVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASLIQPTQVK	lung	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASQYVELANDLEINK	kidney	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASQYVELANDLEINK	lung	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	EIDASYVDPLGPQIERPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	EIDASYVDPLGPQIERPK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ADTIATIEK	dbs	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ADTIATIEK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ADTIATIEK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	DANGRPDAVVAK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	FDLWSLPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	FDLWSLPK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	GEIAEAYAELIK	dbs	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	GEIAEAYAELIK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	GEIAEAYAELIK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ILVVHLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ILVVHLK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ILVVHLK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	dbs	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	Heart	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	Spleen	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	dbs	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	Heart	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	Spleen	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VVEHGLFVK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VVEHGLFVK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	AHEASSAVQHVNLLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	AHEASSAVQHVNLLK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	AHEASSAVQHVNLLK	Spleen	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	DDTLFLK	Spleen	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	HLGDAFKPDPNSSSFK	Heart	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	HLGDAFKPDPNSSSFK	kidney	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	HLGDAFKPDPNSSSFK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	VSLLQNESVEK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	VTELESVDK	lung	—	100.0	None	—
Q13123	IK	AAFQYGIK	lung	—	100.0	None	—
Q13123	IK	AAFQYGIK	Spleen	—	100.0	None	—
Q13123	IK	AAPTSAPPSK	Spleen	—	100.0	None	—

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