SysQuan Core Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/μg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/μg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13347	EIF3I	SGEVLVNVK	liver	—	100.0	None	—
Q13347	EIF3I	SGEVLVNVK	lung	—	100.0	None	—
Q13356	PPIL2	ETLQELYK	kidney	—	100.0	None	—
Q13356	PPIL2	IIDPDEEK	kidney	—	100.0	None	—
Q13356	PPIL2	QDIITLQDPTNLDK	kidney	—	100.0	None	—
Q13363	CTBP1	ALAQALK	lung	—	100.0	None	—
Q13363	CTBP1	GAALDVHESEPFSFSQGPLK	lung	—	100.0	None	—
Q13363	CTBP1	GGLVDEK	lung	—	100.0	None	—
Q13393	PLD1	DWVQLDKPFADFIDR	lung	—	100.0	None	—
Q13393	PLD1	LTDVGSVK	lung	—	100.0	None	—
Q13393	PLD1	SAADWSAGIK	kidney	—	100.0	None	—
Q13393	PLD1	SAADWSAGIK	lung	—	100.0	None	—
Q13393	PLD1	SLSYPFLLPK	liver	—	100.0	None	—
Q13393	PLD1	THAELEGNLVTELIYVHSK	lung	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	DILTTHPFTK	kidney	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	HLTDWIK	kidney	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	QTTEPNFPEILLIAINK	kidney	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	TQPPSWLELQATK	liver	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	VLLPGVKPAYK	kidney	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	WAQLAIAAHK	kidney	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	YIDIHFNK	kidney	—	100.0	None	—
Q13402	MYO7A	YVVALQDNPNPAGEESGFLSFAK	kidney	—	100.0	None	—
Q13404	UBE2V1	AATTGSGVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13404	UBE2V1	AATTGSGVK	liver	—	100.0	None	—
Q13404	UBE2V1	AATTGSGVK	lung	—	100.0	None	—
Q13404	UBE2V1	WQNSYSIK	liver	—	100.0	None	—
Q13409	DYNC1I2	APPHELTEEEK	liver	—	100.0	None	—
Q13409	DYNC1I2	EIVTYTK	lung	—	100.0	None	—
Q13418	ILK	HSGIDFK	plasma	—	100.0	None	—
Q13418	ILK	LNENHSGELWK	kidney	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	AQYPIADLVK	liver	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	AQYPIADLVK	lung	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	EGSVVVDLAAEAGGNFETTK	kidney	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	ESGEGQGGYAK	liver	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	EVDILISTALIPGK	liver	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	ILIVGGGVAGLASAGAAK	liver	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	ILIVGGGVAGLASAGAAK	lung	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	QGFNVVVESGAGEASK	kidney	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	QGFNVVVESGAGEASK	lung	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	QLTVGVPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	SLANVILGGYGTTSTAGGK	liver	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	SLANVILGGYGTTSTAGGK	lung	—	100.0	None	—
Q13423	NNT	VIFPAPTPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13424	SNTA1	ADAGGLGISIK	lung	—	100.0	None	—
Q13424	SNTA1	EVVLEVK	lung	—	100.0	None	—
Q13424	SNTA1	QIGWLTEQLPSGGTAPTLALLTEK	liver	—	100.0	None	—
Q13424	SNTA1	QIGWLTEQLPSGGTAPTLALLTEK	lung	—	100.0	None	—
Q13425	SNTB2	EVLLEVK	lung	—	100.0	None	—
Q13425	SNTB2	EVTPYIK	lung	—	100.0	None	—
Q13425	SNTB2	HIAWLAEQAK	lung	—	100.0	None	—

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