SysQuan Core Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/μg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/μg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13242	SRSF9	DLEDLFYK	liver	—	100.0	None	—
Q13242	SRSF9	DLEDLFYK	lung	—	100.0	None	—
Q13243	SRSF5	DADDAVYELDGK	kidney	—	100.0	None	—
Q13243	SRSF5	LNEGVVEFASYGDLK	liver	—	100.0	None	—
Q13243	SRSF5	VSWQDLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13247	SRSF6	LIEDKPR	kidney	—	100.0	None	—
Q13247	SRSF6	LIEDKPR	lung	—	100.0	None	—
Q13247	SRSF6	QAGEVTYADAHK	liver	—	100.0	None	—
Q13257	MAD2L1	YLNNVVEQLK	liver	—	100.0	None	—
Q13263	TRIM28	EEDGSLSLDGADSTGVVAK	lung	—	100.0	None	—
Q13263	TRIM28	LLASLVK	liver	—	100.0	None	—
Q13263	TRIM28	LLASLVK	lung	—	100.0	None	—
Q13263	TRIM28	VLVNDAQK	liver	—	100.0	None	—
Q13277	STX3	DDLEQLTTEIK	lung	—	100.0	None	—
Q13277	STX3	ISEHVEEAK	kidney	—	100.0	None	—
Q13277	STX3	ISEHVEEAK	lung	—	100.0	None	—
Q13277	STX3	LYSIILSAPIPEPK	lung	—	100.0	None	—
Q13283	G3BP1	HPDSHQLFIGNLPHEVDK	liver	—	100.0	None	—
Q13283	G3BP1	HPDSHQLFIGNLPHEVDK	lung	—	100.0	None	—
Q13283	G3BP1	LPNFGFVVFDDSEPVQK	liver	—	100.0	None	—
Q13283	G3BP1	PADAVYGQK	kidney	—	100.0	None	—
Q13303	KCNAB2	AEVVLGNIIK	kidney	—	100.0	None	—
Q13303	KCNAB2	HIIEGLK	lung	—	100.0	None	—
Q13308	PTK7	VSALGLSK	kidney	—	100.0	None	—
Q13308	PTK7	VSALGLSK	lung	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	EFSPFGSITSAK	liver	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	EFSPFGSITSAK	lung	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	GYAFVHFETQEAADK	liver	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	GYAFVHFETQEAADK	lung	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	SGVGNVFIK	lung	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	VDEAVAVLQAHHAK	liver	—	100.0	None	—
Q13310	PABPC4	VDEAVAVLQAHHAK	lung	—	100.0	None	—
Q13315	ATM	SLIELISK	kidney	—	100.0	None	—
Q13315	ATM	SLIELISK	liver	—	100.0	None	—
Q13322	GRB10	FSDLIQLVDFYQLNK	kidney	—	100.0	None	—
Q13322	GRB10	FSDLIQLVDFYQLNK	lung	—	100.0	None	—
Q13330	MTA1	DFTDIQQDFLPWK	kidney	—	100.0	None	—
Q13330	MTA1	DFTDIQQDFLPWK	lung	—	100.0	None	—
Q13330	MTA1	KPLEAVLR	liver	—	100.0	None	—
Q13330	MTA1	KPLEAVLR	lung	—	100.0	None	—
Q13330	MTA1	QAFYLHTTK	lung	—	100.0	None	—
Q13330	MTA1	YLETHPRPPKPDPVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13332	PTPRS	NVLELTDVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13332	PTPRS	NVLELTDVK	lung	—	100.0	None	—
Q13332	PTPRS	SGEGFIDFIGQVHK	lung	—	100.0	None	—
Q13332	PTPRS	VLAFTSVGDGPLSDPIQVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13332	PTPRS	VLAFTSVGDGPLSDPIQVK	lung	—	100.0	None	—
Q13347	EIF3I	EGDLLFTVAK	lung	—	100.0	None	—
Q13347	EIF3I	GHFGPINSVAFHPDGK	lung	—	100.0	None	—
Q13347	EIF3I	LFDSTTLEHQK	kidney	—	100.0	None	—

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