SysQuan Core Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/μg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/μg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13148	TARDBP	LVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPK	liver	—	100.0	None	—
Q13148	TARDBP	TSDLIVLGLPWK	liver	—	100.0	None	—
Q13151	HNRNPA0	AEIIADK	kidney	—	100.0	None	—
Q13153	PAK1	IAKPLSSLTPLIAAAK	kidney	—	100.0	None	—
Q13153	PAK1	PLSSLTPLIAAAK	kidney	—	100.0	None	—
Q13153	PAK1	SIVSVGDPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13155	AIMP2	AAVDGLSK	lung	—	100.0	None	—
Q13155	AIMP2	FLFSLFGQK	liver	—	100.0	None	—
Q13155	AIMP2	FLFSLFGQK	lung	—	100.0	None	—
Q13155	AIMP2	VLSTVHTHSSVK	liver	—	100.0	None	—
Q13155	AIMP2	VLSTVHTHSSVK	lung	—	100.0	None	—
Q13162	PRDX4	LVQAFQYTDK	plasma	—	100.0	None	—
Q13162	PRDX4	VSVADHSLHLSK	kidney	—	100.0	None	—
Q13164	MAPK7	HDNIIAIK	lung	—	100.0	None	—
Q13164	MAPK7	SQVEDPLPPVFSGTPK	lung	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	ALYLIATNGTPELQNPEK	liver	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	ALYLIATNGTPELQNPEK	lung	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	DPLSANHSLKPLPSVPEEK	kidney	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	DPLSANHSLKPLPSVPEEK	liver	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	DPLSANHSLKPLPSVPEEK	lung	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	ELLQHPFLK	dbs	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	ELLQHPFLK	lung	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	IGQGASGTVFTATDVALGQEVAIK	liver	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	IGQGASGTVFTATDVALGQEVAIK	lung	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	IISIFSGTEK	kidney	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	IISIFSGTEK	plasma	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	LLQTSNITK	kidney	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	LLQTSNITK	plasma	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	NPQAVLDVLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	NPQAVLDVLK	liver	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	NPQAVLDVLK	lung	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	SDNGELEDKPPAPPVR	kidney	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	SDNGELEDKPPAPPVR	liver	—	100.0	None	—
Q13177	PAK2	SDNGELEDKPPAPPVR	lung	—	100.0	None	—
Q13185	CBX3	DSDEADLVLAK	lung	—	100.0	None	—
Q13185	CBX3	SLSDSESDDSK	kidney	—	100.0	None	—
Q13185	CBX3	SLSDSESDDSK	lung	—	100.0	None	—
Q13185	CBX3	VEEAEPEEFVVEK	kidney	—	100.0	None	—
Q13185	CBX3	VEEAEPEEFVVEK	lung	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	ATATQLLQHPFIK	liver	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	ATATQLLQHPFIK	lung	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	KPELWSDDFTDFVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	KPELWSDDFTDFVK	lung	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	LSEDSLTK	kidney	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	NAKPVSILR	lung	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	QVPVESDLQEIIK	kidney	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	VPQDGDFDFLK	liver	—	100.0	None	—
Q13188	STK3	VPQDGDFDFLK	lung	—	100.0	None	—
Q13190	STX5	AVEIEELTYIIK	lung	—	100.0	None	—
Q13190	STX5	DLSNTFAK	liver	—	100.0	None	—

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