SysQuan Core Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/μg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/μg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13099	IFT88	ASQYVELANDLEINK	kidney	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASQYVELANDLEINK	lung	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	EIDASYVDPLGPQIERPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	DANGRPDAVVAK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	FDLWSLPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	FDLWSLPK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ILVVHLK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	ILVVHLK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	liver	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	NDSVIVDTFHGLFK	lung	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	dbs	—	100.0	None	—
Q13107	USP4	VEVYLLELK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	AHEASSAVQHVNLLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	AHEASSAVQHVNLLK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	HLGDAFKPDPNSSSFK	kidney	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	HLGDAFKPDPNSSSFK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	VSLLQNESVEK	lung	—	100.0	None	—
Q13114	TRAF3	VTELESVDK	lung	—	100.0	None	—
Q13123	IK	AAFQYGIK	lung	—	100.0	None	—
Q13123	IK	DSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSK	kidney	—	100.0	None	—
Q13123	IK	DSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSK	liver	—	100.0	None	—
Q13123	IK	DSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSK	lung	—	100.0	None	—
Q13123	IK	FAGSAGWEGTESLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13123	IK	GLDFALLQK	kidney	—	100.0	None	—
Q13123	IK	HSYFEKPK	liver	—	100.0	None	—
Q13123	IK	HSYFEKPK	lung	—	100.0	None	—
Q13123	IK	QLIQESK	kidney	—	100.0	None	—
Q13123	IK	QLIQESK	lung	—	100.0	None	—
Q13126	MTAP	PSDALILGK	liver	—	100.0	None	—
Q13126	MTAP	YVDTPFGKPSDALILGK	kidney	—	100.0	None	—
Q13126	MTAP	YVDTPFGKPSDALILGK	liver	—	100.0	None	—
Q13126	MTAP	YVDTPFGKPSDALILGK	lung	—	100.0	None	—
Q13129	RLF	ILSQQPVETEEVNK	lung	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	HTLDELNPQK	kidney	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	HTLDELNPQK	liver	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	HTLDELNPQK	lung	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	IGHYILGDTLGVGTFGK	liver	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	IGHYILGDTLGVGTFGK	lung	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	QLDYEWK	liver	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	SIDDEITEAK	lung	—	100.0	None	—
Q13131	PRKAA1	SLDVVGK	kidney	—	100.0	None	—
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Q13136	PPFIA1	ETQETLALTQGK	liver	—	100.0	None	—
Q13136	PPFIA1	LELAEQK	kidney	—	100.0	None	—
Q13136	PPFIA1	LELAEQK	lung	—	100.0	None	—
Q13136	PPFIA1	NSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHK	kidney	—	100.0	None	—
Q13136	PPFIA1	NSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHK	lung	—	100.0	None	—
Q13136	PPFIA1	WILSIGLK	lung	—	100.0	None	—
Q13148	TARDBP	FTEYETQVK	lung	—	100.0	None	—
Q13148	TARDBP	GISVHISNAEPK	liver	—	100.0	None	—

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