SysQuan Core Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/μg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/μg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13043	STK4	TLTEDEIATILQSTLK	liver	—	100.0	None	—
Q13043	STK4	TLTEDEIATILQSTLK	lung	—	100.0	None	—
Q13043	STK4	TLTEDEIATILQSTLK	plasma	—	100.0	None	—
Q13043	STK4	YYGSYFK	liver	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	FESLFPGK	kidney	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	FESLFPGK	lung	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	GGYFPENVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	GGYFPENVK	liver	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	NSGVPDDIFK	lung	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	SLEGTEAQVFK	kidney	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	SLEGTEAQVFK	liver	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	SLEGTEAQVFK	lung	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	SLEGTEAQVFK	plasma	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	VGLGLGYLELPQINYK	lung	—	100.0	None	—
Q13045	FLII	WDQGLEKPR	lung	—	100.0	None	—
Q13049	TRIM32	EILHFPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13049	TRIM32	ELTLQDVELLK	liver	—	100.0	None	—
Q13049	TRIM32	ELTLQDVELLK	lung	—	100.0	None	—
Q13049	TRIM32	ITSLTQLTDNLTVLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13049	TRIM32	ITSLTQLTDNLTVLK	lung	—	100.0	None	—
Q13049	TRIM32	VGHVGPLQIGQAVK	lung	—	100.0	None	—
Q13077	TRAF1	VVELQQTLAQK	lung	—	100.0	None	—
Q13084	MRPL28	DPVPLFK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	AYVWDNNK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	FIIGSVSEDNSEDEISNLVK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	GSVLEPEGTVEIK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	IIEFVPTK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	IIQQAGQVWFPDSAFK	kidney	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	IIQQAGQVWFPDSAFK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	IPVQAVWAGWGHASENPK	kidney	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	IPVQAVWAGWGHASENPK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	LLLEDLVK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	LLLEDLVK	lung	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	LPELLLK	kidney	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	LPELLLK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	LTFLVAQK	kidney	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	LTFLVAQK	lung	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	SVHSSVPLLNSK	lung	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	TVELSIPADPANLDSEAK	kidney	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	TVELSIPADPANLDSEAK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	TVELSIPADPANLDSEAK	plasma	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	VDWQENDFSK	lung	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	VETQFQNGHYDK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	YLYLTPQDYK	liver	—	100.0	None	—
Q13085	ACACA	YLYLTPQDYK	lung	—	100.0	None	—
Q13094	LCP2	FLNLTENDIQK	lung	—	100.0	None	—
Q13094	LCP2	FLNLTENDIQK	plasma	—	100.0	None	—
Q13098	GPS1	VSVYLQNWSHVLSYVSK	kidney	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASLIQPTQVK	kidney	—	100.0	None	—
Q13099	IFT88	ASLIQPTQVK	lung	—	100.0	None	—

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