SysQuan Core Database

Fast, large-scale absolute quantification for human samples. Unlike traditional methods requiring expensive synthetic peptides for each target, SysQuan uses metabolically K6-labeled mouse tissues with pre-quantified proteins. Simply mix your human samples with our standardized mouse tissue extracts to achieve absolute quantification across the entire proteome.

How to Use:

Search for proteins by gene name, UniProt accession, or peptide sequence
Filter by tissue type or assay availability (MRM, PRM-PASEF)
Select peptides to add them to your cart
Access MRM/PRM transitions, calibration curves, and observed peptide spectra
Download assay data

Available Data:

Optimized MRM & PRM-PASEF transitions for targeted MS
Absolute quantification calibration curves (fmol/μg)
Observed peptide MS/MS spectra from mouse tissues
Multi-tissue coverage across mouse organs

Use the SysQuan Kit: Pre-quantified K6-labeled mouse tissue extracts ready to spike into your human samples for rapid absolute quantification—no need for expensive synthetic peptide standards!

Uniprot ID	Gene	Peptide Sequence	Tissue	Mouse Conc. (fmol/μg)	Incorp. (%)	Assays Available	PTM
Q13439	GOLGA4	EQQESLALEELELQK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q13439	GOLGA4	EQQESLALEELELQK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13496	MTM1	YNSHSLENESIK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13496	MTM1	YNSHSLENESIK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13574	DGKZ	TLLHHAVSTGSK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q13574	DGKZ	TLLHHAVSTGSK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13574	DGKZ	TLLHHAVSTGSK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13613	MTMR1	LGIFENLNK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13613	MTMR1	LGIFENLNK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13614	MTMR2	IFIFDARPSVNAVANK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q13614	MTMR2	IFIFDARPSVNAVANK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13618	CUL3	GLTEQEVETILDK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13618	CUL3	GLTEQEVETILDK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13642	FHL1	QVIGTGSFFPK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q13642	FHL1	QVIGTGSFFPK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13642	FHL1	QVIGTGSFFPK	lung	—	100.0	MRM	—
Q13867	BLMH	TLYNNQPIDFLK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13885	TUBB2A	INVYYNEAAGNK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q13885	TUBB2A	INVYYNEAAGNK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q13907	IDI1	AFSVFLFNTENK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q13907	IDI1	AFSVFLFNTENK	liver	—	100.0	MRM	—
Q13907	IDI1	NVTLNPDPNEIK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14019	COTL1	EVVQNFAK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14103	HNRNPD	IFVGGLSPDTPEEK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14103	HNRNPD	IFVGGLSPDTPEEK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14103	HNRNPD	IFVGGLSPDTPEEK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14204	DYNC1H1	LGGSPFGPAGTGK	liver	—	100.0	MRM	—
Q14204	DYNC1H1	VDDLLIIEEK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14204	DYNC1H1	VDDLLIIEEK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14204	DYNC1H1	VDDLLIIEEK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14247	CTTN	SAVGFEYQGK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14376	GALE	DYIHVVDLAK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14520	HABP2	DEIPHNDIALLK	liver	—	100.0	MRM	—
Q14520	HABP2	DEIPHNDIALLK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14534	SQLE	ELHAPLTVVADGLFSK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14642	INPP5A	AADTNEVVK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14642	INPP5A	NIYQFDFK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14651	PLS1	EELEELQEAFNK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14651	PLS1	EELEELQEAFNK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14693	LPIN1	NLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14766	LTBP1	EAQPGQSQVSYQGLPVQK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14766	LTBP1	EAQPGQSQVSYQGLPVQK	liver	—	100.0	MRM	—
Q14766	LTBP1	EAQPGQSQVSYQGLPVQK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14847	LASP1	IVYPTEK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q14974	KPNB1	GALQYLVPILTQTLTK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14974	KPNB1	LAATNALLNSLEFTK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q14974	KPNB1	LAATNALLNSLEFTK	lung	—	100.0	MRM	—
Q14974	KPNB1	LAATNALLNSLEFTK	plasma	—	100.0	MRM	—
Q15008	PSMD6	PLENLEEEGLPK	kidney	—	100.0	MRM	—
Q15008	PSMD6	PLENLEEEGLPK	plasma	—	100.0	MRM	—

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